1、如果个体户本身已经是一般纳税人的，且销售的农副产品属于农业产品或农业初级产品的，有税收优惠*策免税自愿放弃的，应该开具9%的专票。
（1）农产品以及初级产品范围详见《农业产品征税范围注释》（财税字[]52号）。
（2）流通领域（批发、零售）销售蔬菜、部分鲜活肉蛋本来可以享受增值税免税开具免税普通发票，如果要开具9%专票，则销售方需要放弃优惠*策的享受。
2、如果个体户是小规模纳税人的，可以开具3%的增值税专用发票，购买方的食品公司，可以按照增值税专用发票上注明的金额和9%的扣除率计算进项税额（如果是深加工13%食品，可以按照10%扣除率计算进项税额）。
因此，您可以结合上述规定，跟食品公司进行协商，不是一般纳税人开具3%税率的专票，对方也是可以抵扣9%或10%的进项税额，同等含税价的情形下实际比开具专票抵扣更多，只要对方不是傻子就应该可以接受。